Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CITO14578 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CITO14578 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CITO14578 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CITO14578 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CITO14578 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CITO14578 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CITO14578 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CITO14578 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CITO14578 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CITO14578 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CITO14578 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CITO14578 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CITO14578 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CITO14578 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CITO14578 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CITO14578 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CITO14578 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CITO14578 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CITO14578 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CITO14578 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CITO14578 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CITO14578 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CITO14578 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CITO14578 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CITO14578 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CITO14578 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CITO14578 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CITO14578 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CITO14578 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CITO14578 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CITO14578 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CITO14578 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CITO14578 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CITO14578 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CITO14578 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CITO14578 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CITO14578 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CITO14578 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CITO14578 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CITO14578 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CITO14578 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CITO14578 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CITO14578 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CITO14578 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CITO14578 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CITO14578 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CITO14578 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CITO14578 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CITO14578 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CITO14578 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CITO14578 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CITO14578 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CITO14578 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CITO14578 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CITO14578 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CITO14578 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CITO14578 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CITO14578 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CITO14578 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CITO14578 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CITO14578 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CITO14578 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CITO14578 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CITO14578 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CITO14578 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CITO14578 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CITO14578 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CITO14578 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CITO14578 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CITO14578 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CITO14578 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CITO14578 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CITO14578 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CITO14578 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CITO14578 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CITO14578 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CITO14578 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CITO14578 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CITO14578 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CITO14578 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CITO14578 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CITO14578 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CITO14578 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CITO14578 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CITO14578 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CITO14578 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CITO14578 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CITO14578 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CITO14578 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CITO14578 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CITO14578 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms