Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sprr3O09116 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr3O09116 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sprr3O09116 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr3O09116 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.1 ms