Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh11O08638 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Myh11O08638 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh11O08638 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh11O08638 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Myh11O08638 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh11O08638 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Myh11O08638 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh11O08638 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh11O08638 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh11O08638 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh11O08638 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myh11O08638 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myh11O08638 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myh11O08638 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myh11O08638 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms