Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U90926O08546 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U90926O08546 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U90926O08546 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U90926O08546 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U90926O08546 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U90926O08546 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U90926O08546 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U90926O08546 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U90926O08546 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U90926O08546 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U90926O08546 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U90926O08546 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U90926O08546 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U90926O08546 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U90926O08546 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U90926O08546 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
U90926O08546 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U90926O08546 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U90926O08546 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
U90926O08546 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U90926O08546 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U90926O08546 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U90926O08546 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U90926O08546 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U90926O08546 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U90926O08546 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U90926O08546 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U90926O08546 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U90926O08546 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U90926O08546 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U90926O08546 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U90926O08546 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
U90926O08546 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U90926O08546 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U90926O08546 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U90926O08546 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U90926O08546 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
U90926O08546 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
U90926O08546 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U90926O08546 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
U90926O08546 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U90926O08546 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U90926O08546 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
U90926O08546 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U90926O08546 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
U90926O08546 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
U90926O08546 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
U90926O08546 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U90926O08546 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
U90926O08546 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
U90926O08546 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U90926O08546 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U90926O08546 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
U90926O08546 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U90926O08546 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U90926O08546 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
U90926O08546 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
U90926O08546 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
U90926O08546 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U90926O08546 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
U90926O08546 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U90926O08546 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U90926O08546 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
U90926O08546 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
U90926O08546 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
U90926O08546 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
U90926O08546 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U90926O08546 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U90926O08546 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
U90926O08546 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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