Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efna3O08545 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efna3O08545 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efna3O08545 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efna3O08545 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna3O08545 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efna3O08545 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Efna3O08545 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efna3O08545 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna3O08545 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna3O08545 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna3O08545 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Efna3O08545 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Efna3O08545 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms