Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
UBE2CO00762 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBE2CO00762 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBE2CO00762 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
UBE2CO00762 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms