Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3FO00303 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF3FO00303 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF3FO00303 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms