Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP1O00294 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP1O00294 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP1O00294 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP1O00294 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP1O00294 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TULP1O00294 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TULP1O00294 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TULP1O00294 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TULP1O00294 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TULP1O00294 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP1O00294 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP1O00294 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TULP1O00294 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP1O00294 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP1O00294 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP1O00294 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TULP1O00294 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TULP1O00294 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TULP1O00294 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP1O00294 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TULP1O00294 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TULP1O00294 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP1O00294 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP1O00294 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP1O00294 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP1O00294 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TULP1O00294 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TULP1O00294 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TULP1O00294 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP1O00294 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP1O00294 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP1O00294 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TULP1O00294 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP1O00294 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP1O00294 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP1O00294 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TULP1O00294 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP1O00294 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP1O00294 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP1O00294 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP1O00294 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP1O00294 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TULP1O00294 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TULP1O00294 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP1O00294 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TULP1O00294 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP1O00294 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP1O00294 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TULP1O00294 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP1O00294 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TULP1O00294 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP1O00294 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP1O00294 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TULP1O00294 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TULP1O00294 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TULP1O00294 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms