Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGPSO00116 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPSO00116 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPSO00116 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPSO00116 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPSO00116 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPSO00116 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGPSO00116 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPSO00116 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPSO00116 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPSO00116 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGPSO00116 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPSO00116 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPSO00116 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPSO00116 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPSO00116 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPSO00116 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGPSO00116 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPSO00116 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPSO00116 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPSO00116 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGPSO00116 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPSO00116 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPSO00116 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPSO00116 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPSO00116 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPSO00116 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGPSO00116 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGPSO00116 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGPSO00116 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGPSO00116 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGPSO00116 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGPSO00116 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPSO00116 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPSO00116 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPSO00116 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPSO00116 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGPSO00116 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGPSO00116 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPSO00116 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPSO00116 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGPSO00116 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPSO00116 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPSO00116 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPSO00116 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGPSO00116 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGPSO00116 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGPSO00116 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGPSO00116 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGPSO00116 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
AGPSO00116 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGPSO00116 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGPSO00116 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AGPSO00116 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGPSO00116 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPSO00116 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPSO00116 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGPSO00116 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPSO00116 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPSO00116 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPSO00116 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPSO00116 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPSO00116 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGPSO00116 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPSO00116 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPSO00116 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPSO00116 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPSO00116 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPSO00116 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGPSO00116 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPSO00116 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPSO00116 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPSO00116 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGPSO00116 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGPSO00116 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGPSO00116 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGPSO00116 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPSO00116 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPSO00116 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGPSO00116 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPSO00116 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPSO00116 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPSO00116 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPSO00116 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGPSO00116 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGPSO00116 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPSO00116 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPSO00116 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPSO00116 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AGPSO00116 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPSO00116 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPSO00116 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPSO00116 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPSO00116 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AGPSO00116 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGPSO00116 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
AGPSO00116 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AGPSO00116 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPSO00116 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AGPSO00116 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms