Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm3453K7N724 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm3453K7N724 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3453K7N724 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm3453K7N724 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm3453K7N724 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms