Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700122O11RikJ3QPW6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700122O11RikJ3QPW6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700122O11RikJ3QPW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700122O11RikJ3QPW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700122O11RikJ3QPW6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700122O11RikJ3QPW6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms