Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccer2J3QPU5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ccer2J3QPU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccer2J3QPU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccer2J3QPU5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccer2J3QPU5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms