Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm28051J3QMA2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm28051J3QMA2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm28051J3QMA2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms