Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CROCC2H7BZ55 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CROCC2H7BZ55 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CROCC2H7BZ55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CROCC2H7BZ55 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
CROCC2H7BZ55 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CROCC2H7BZ55 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms