Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms