Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20696H3BJN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20696H3BJN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20696H3BJN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20696H3BJN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20696H3BJN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms