Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf4bG5E8Z2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf4bG5E8Z2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Taf4bG5E8Z2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Taf4bG5E8Z2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Taf4bG5E8Z2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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