Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nkx1-1G3UXB3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nkx1-1G3UXB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nkx1-1G3UXB3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nkx1-1G3UXB3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms