Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28048F7BCN0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28048F7BCN0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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