Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 443.5 ms