Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm28305F6U473 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm28305F6U473 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28305F6U473 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 818.4 ms