Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm340F6RGI3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm340F6RGI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm340F6RGI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm340F6RGI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm340F6RGI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms