Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa27F2Z403 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa27F2Z403 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa27F2Z403 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms