Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc146E9Q9F7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc146E9Q9F7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc146E9Q9F7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc146E9Q9F7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc146E9Q9F7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms