Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Col22a1E9Q7P1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Col22a1E9Q7P1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Col22a1E9Q7P1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Col22a1E9Q7P1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Col22a1E9Q7P1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Col22a1E9Q7P1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Col22a1E9Q7P1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Col22a1E9Q7P1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Col22a1E9Q7P1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col22a1E9Q7P1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col22a1E9Q7P1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Col22a1E9Q7P1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Col22a1E9Q7P1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms