Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Urb2E9Q7L1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Urb2E9Q7L1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Urb2E9Q7L1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Urb2E9Q7L1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Urb2E9Q7L1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Urb2E9Q7L1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Urb2E9Q7L1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Urb2E9Q7L1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Urb2E9Q7L1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Urb2E9Q7L1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms