Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ApobE9Q414 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ApobE9Q414 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ApobE9Q414 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ApobE9Q414 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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