Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CenpfE9Q3P4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CenpfE9Q3P4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpfE9Q3P4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpfE9Q3P4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CenpfE9Q3P4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms