Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ryr1E9PZQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ryr1E9PZQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ryr1E9PZQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ryr1E9PZQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms