Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Rsf1E9PWW9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Rsf1E9PWW9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rsf1E9PWW9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rsf1E9PWW9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rsf1E9PWW9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rsf1E9PWW9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rsf1E9PWW9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rsf1E9PWW9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Rsf1E9PWW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Rsf1E9PWW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Rsf1E9PWW9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Rsf1E9PWW9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Rsf1E9PWW9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Rsf1E9PWW9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms