Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim30dE9PWL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim30dE9PWL0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trim30dE9PWL0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trim30dE9PWL0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trim30dE9PWL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.3 ms