Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prrt2E9PUL5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrt2E9PUL5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prrt2E9PUL5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt2E9PUL5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms