Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Soga1E1U8D0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Soga1E1U8D0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Soga1E1U8D0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Soga1E1U8D0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Soga1E1U8D0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Soga1E1U8D0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Soga1E1U8D0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Soga1E1U8D0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms