Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb3D3Z6J4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb3D3Z6J4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms