Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930595D18RikD3Z642 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4930595D18RikD3Z642 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930595D18RikD3Z642 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930595D18RikD3Z642 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms