Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms