Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
9630041A04RikD3Z3U4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
9630041A04RikD3Z3U4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
9630041A04RikD3Z3U4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms