Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccnb1ip1D3Z3K2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms