Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
3425401B19RikD3Z1D3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
3425401B19RikD3Z1D3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
3425401B19RikD3Z1D3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
3425401B19RikD3Z1D3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
3425401B19RikD3Z1D3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms