Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm17333C6EQI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm17333C6EQI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm17333C6EQI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm17333C6EQI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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