Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CatipB9EKE5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CatipB9EKE5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CatipB9EKE5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CatipB9EKE5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CatipB9EKE5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CatipB9EKE5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CatipB9EKE5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CatipB9EKE5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CatipB9EKE5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CatipB9EKE5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms