Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
1700006A11RikB9EHI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
1700006A11RikB9EHI3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
1700006A11RikB9EHI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700006A11RikB9EHI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700006A11RikB9EHI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700006A11RikB9EHI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700006A11RikB9EHI3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700006A11RikB9EHI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700006A11RikB9EHI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms