Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syce3B5KM66 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syce3B5KM66 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syce3B5KM66 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syce3B5KM66 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syce3B5KM66 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms