Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprbB2RU80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprbB2RU80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PtprbB2RU80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtprbB2RU80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms