Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ythdc2B2RR83 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ythdc2B2RR83 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ythdc2B2RR83 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ythdc2B2RR83 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ythdc2B2RR83 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ythdc2B2RR83 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ythdc2B2RR83 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms