Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HMGB1P1B2RPK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HMGB1P1B2RPK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms