Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VGLL3A8MV65 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VGLL3A8MV65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VGLL3A8MV65 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VGLL3A8MV65 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VGLL3A8MV65 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms