Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYCE1LA8MT33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYCE1LA8MT33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCE1LA8MT33 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1LA8MT33 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1LA8MT33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms