Protein–RNA interactions for Protein: A7XV14

Skint11, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint11A7XV14 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint11A7XV14 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint11A7XV14 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skint11A7XV14 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skint11A7XV14 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Skint11A7XV14 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms