Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2c2A7L9Z8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2c2A7L9Z8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2c2A7L9Z8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2c2A7L9Z8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2c2A7L9Z8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms